某市国税局在一次普通发票检查中，发现其所属辖区某国有企业投资的下属公司擅自使用收据，不申报纳税。于是，国税局的办案人员依法要求其限期改正，并提供以前经营中使用的票据。而该公司以自己未办理工商营业执照为由，声称其不具备法人资格，不是纳税主体，因此没有纳税义务，并且拒不改正错误，拒不接受税务机关的检查，拒不提供账簿。在无法从正面查清事实的情况下，办案人员从侧面出击，寻找消费者了解情况。根据多方调查取证，得知该公司与上级母公司存在着业务上的指导关系，但人员管理独立，经费自收自支，属独立核算企业，并找到了该公司开具的业务收费凭证。根据事实，办案人员下达了《税收违法事项限期改正通知书》，以及《税收处罚事项告知通知书》，对其未按照规定办理税务登记、未按照规定使用发票、未按照规定申报纳税的行为进行处罚，并要求限期改正。税务机关的处罚是否正确？