你纯化出经BamHI消化重组DNA所得的两个DNA片段，其中一个长为400bp，另一个长900bp，你想要如图16-3-20(1)所示将它们连接起来产生一个杂合基因，如果你的推测是正确的话，就会得到令人惊奇的新物质。 你在DNA连接酶存在情况下将两种片段混合在一起并且进行孵育，30分钟后和8小时后，你取一些样品进行琼脂糖凝胶电泳分析，你惊讶地发现连接得到了一系列复杂的DNA片段而不是所需的1.3kb小片段，并且发现孵育时间越长，小片段浓度越低而大片段浓度增加，如果你用BamHI切割连接后的重组体，你会重新获得开始的两片段(图16-3-20(2)A)。 令人吃惊的是，你将从琼脂糖凝胶中纯化得到的1.3kb片段用BamHI消化，检查它的结构，与预想的一样，可以得到最初的两片段(图16-3-20(2)B)。这就可以确定这是你所需的结构。但是，你用EcoRl消化另一份样品，你希望通过消化得到300bp的片段和700bp的片段，但你跑的电泳是一系列DNA片段(图16-3-20(2)B)。